2006年，国家财政科技拨款额为1688.5亿元，比上年增加353.6亿元，增长26.5%；科技拨款占当年国家财政支出的比重为4.2%，为1998年以来的最高水平。在国家财政科技拨款中，中央财政科技拨款为1009.7亿元，比上年增长25%，占中央财政支出的比例为10.3%；地方财政科技拨款为678.8亿元，比上年增长28.8%，占地方财政支出的比重为2.2%，比上年略有提高。